Ученые в Великобритании разработали новый метод тестирования, при котором определяется, каким штаммом SARS-CoV-2 инфицирован пациент, сообщает РИА Новости со ссылкой на medRxiv.org.
Новая разработка представляет собой метод обнаружения в режиме реального времени вирусных вариантов при помощи количественной полимеразной цепной реакции (ПЦР) даже в образцах с низким содержанием вирусной РНК или с деградированной РНК.
Тестирование довольно точно обнаруживает штаммы и линии происхождения коронавируса во взятых из носоглотки пациента образцах.
Ранее для ПЦР-тестов с обнаружением новых вариантов SARS-CoV-2 использовался метод полногеномного секвенирования нового поколения (NGS). Но для его применения нужны были очень качественные образцы и высокий уровень вирусной РНК, чего невозможно добиться при тестировании пациентов на поздних стадиях болезни
Новый метод назвали аллель-специфической зондовой ПЦР. Сообщается, что таким образом были исследованы 717 образцов, взятых у британских пациентов. И 365 – у бразильских, которые явно заражены отличными штаммами, что и подтвердило исследование.
Как оказалось, у британцев вирус имел мутацию D1118H, которая присуща альфа-варианту, а у бразильцев – мутации K417T и L3468V, указывающие на гамма-вариант коронавируса.
