Небольшая популяция нелетающих попугаев какапо с новозеландского острова Стьюарт, находящаяся в изоляции не менее десяти тысяч лет, из-за близкородственного скрещивания теряет генетическое разнообразие. Но, как оказалось, у данных птиц накоплено намного меньше опасных мутаций, чем у их вымерших сородичей с Южного острова. А произошло это благодаря тому, что в маленькой инбредной популяции естественному отбору легче устранять вредоносные генетические варианты.
Известно, что у попугаев какапо уже давно потеряна способность к полету. Они хорошо приспособились к жизни на земле у подножий деревьев и кустарников. Но в результате браконьерского истребления к началу XXI века их осталось около 200 особей.
В связи с тем, что по существующим предположениям эти попугаи находятся на грани вымирания, ученые во главе с Николасом Дассексом (Nicolas Dussex) из Центра палеогенетики в Стокгольме решили определить факторы, способствующие этому. И самой первый предполагаемой причиной вымирания, как считали учёные, являлось генетическое вырождение.
Специалистами в связи с этим были проанализированы ДНК умерших и живых птиц. В результате установлено, что такой способ исчезновения им не грозит.
Анализ участков генома, находящихся под сильным влиянием отбора, показал, что у островных птиц в 1,1 раза меньше вредоносных мутаций, чем у представителей вымершей популяции с Южного острова. В наибольшей степени эта разница заметна для аллелей, которые подвержены самому сильному воздействию естественного отбора.
А анализ отдельных генов показал, что какапо со Стьюарта несут в 1,9 раза больше мутаций, выключающих функции гена, чем их исчезнувшие сородичи с Южного острова (17,6 мутации на геном против 34,1 мутации на геном).
Но несмотря на это, у в современной популяции все равно регулярно встречаются вредоносные генетические варианты, которые отрицательно сказываются на дальнейших перспективах вида.
Подробнее об этом можно прочитать в журнале Cell Genomics.