В трех исследованиях, проведенных в рамках инициативы “Карта раковых клеток”, ученые обнаружили ранее неизвестные взаимодействия между белками, вызывающими рак, и объединили эти новые данные для создания карты белковых путей, по которым можно судить о развитии злокачественных опухолей.
Новый подход исследователей предлагает основу, которая может улучшить понимание учеными прогрессирования рака и помочь определить терапевтические мишени. Для многих видов рака, которые являются генетическими заболеваниями, существует обширный каталог генетических мутаций. Но сводной карты, которая бы организовывала эти мутации в пути, ведущие к росту опухоли, не существует.
“Более четкая картина сложится, если механизмы, критически важные для роста опухоли, будут лучше организованы в определенные пути. Выявление и объединение этих путей, а также определение того, как комбинации путей приводят к раку, упростит наш поиск эффективных методов лечения рака”. – пишут Ран Ченг и Питер К. Джексон.
Сети белок-белкового взаимодействия (PPIs) являются важными инструментами в этой работе, поскольку они выходят за рамки списков генов и определяют биохимию белков опухолевых путей и мишеней для лекарств.
Даниэль Суони и другие ученые изучили данные о белок-белковых взаимодействиях в плоскоклеточных линиях головы и шеи. Они сообщают, что эти раковые линии показали сотни различных взаимодействий по сравнению с нераковыми линиями и друг с другом. Взаимодействия с PI3K – путем, который обычно мутирует в опухолях, — предсказывали реакцию на лекарства, сообщили специалисты.
Ученые сосредоточились на раке молочной железы и выявили два белка, связанных с геном-супрессором опухоли BRCA1, а также два белка, регулирующих PIK3CA. Они объединили новые данные SCI с существующими общедоступными данными для создания карты белковых путей, которую использовали для выявления ранее труднодоступных мутаций, потенциально важных для метастазирования опухоли. Эти исследования предоставляют ресурс, который будет полезен при интерпретации геномных данных о раке.
Исследование ученых опубликовано в издании Science.
