Учеными установлено, что существует общий отбор внутри хозяина SARS-CoV-2, действующий на бессмысленные мутации. Эта особенность имеет решающее значение для методов оценки скорости изменений вируса.
В предыдущих исследованиях отмечалось, что возбудитель Covid-19 подвержен изменению, которое происходит примерно один раз в две недели. Но в новом исследовании британские и шотландские генетики (из Центра эволюции Милнера при Университете Бата и Эдинбургского университета) определили, что прежние оценки не учитывали некоторые произошедшие мутации, которые так и не были идентифицированы при помощи секвенирования.
Известно, что вирусы мутируют постоянно, к примеру, когда происходят ошибки при копировании геномов во время репликации вируса. Обычно, когда речь идёт о естественном отборе, имеются в виду новые мутации, имеющие преимущество и распространяющиеся, например, как альфа и дельта-варианты COVID-19. Это является положительным отбором.
У вирусов основная часть изменений вредна, она снижает его шансы на выживание — это очищающий, или отрицательный отбор. Такие мутации не живут достаточно долго, чтобы их можно было секвенировать, поэтому очень часто они не попадают в расчеты скорости изменений патогена.
При прогнозировании этих отсутствующих мутаций исследователями установлено, что их реальное количество, по крайней мере, на 50% выше, чем считалось до этого. То есть происходит один раз в неделю.
Авторами исследования отмечается, что если пациент страдает от COVID-19 более нескольких недель, то вирус может эволюционировать. Так, например, установлено, что альфа-вариант является результатом такой эволюции вируса внутри организма человека.
Подробнее об этом можно прочитать в журнале Genome Biology and Evolution.
