Исследователи из Иллинойского Университета в Урбане-Шампейне смогли создать программное обеспечение с GPU-ускорением для моделирования жизненных процессов клетки, состоящей из 2 миллиардов атомов. Клетка ведет себя как обычная живая клетка – в ней происходит метаболизм. Это уникальная возможность наблюдать за процессами, происходящими в клетке при изменении условий ее существования.
Модель за 20 минут имитирует семь тысяч процессов обработки генетической информации, происходящих в клетке. Но даже в этом случае это упрощенная модель. В живой клетке все гораздо сложнее. Ученые говорят, что это самая длинная и сложная симуляция клетки на данный момент. Специалистам пришлось оставить всего 500 генов, необходимых для выживания клетки. Например, кишечная палочка содержит 5 000 генов. Количество сохраненных генов позволило клетке нормально развиваться и даже достичь стадии репликации.
Модель клетки синтезирует белки, вырабатывает энергию, транскрибирует гены и делает многое из того, что происходит в живой клетке.
Модель может быть эффективна при изучении действия лекарств и создании новых препаратов. Кроме того, использование новых ускорителей RTX A5000 увеличило производительность на 40% по сравнению с предыдущими GPU NVIDIA.
